On admet que Tombouctou fut fondee au debut du XII°  siecle par des tribus nomades qui avaient l habitude de se deplacer avec leurs troupeaux entre la ville d Araouan au Sahara et le village d’Amtagh, sur les bords du Niger. Ils deciderent d etablir un campement definitif dans une depression ou l eau, abondante en toute saison, etait excellente et la vegetation relativement luxuriante. Ils y deposait sous la garde d’une vieille femme bellah, « Bouctou » leur provisions : d ou le nom de Tombouctou (Tin-Bouctou). Ainsi, Tombouctou proviendrait de l’agrandissement de ce campement Touareg. Par la suite, Tombouctou devient le carrefour des caravanes et le debouche de la plupart des routes transsahariennes

Cette situation favorisa l immigration de marabouts arabo-berberes au XVe siecle et celle d elites au début du XVIe siecle. Ainsi, on vit arriver à  Tombouctou dès la premiere moitie du XVe siecle deux grandes familles de LETTRES : les AGIT et les ANDA Az MOHAMED. Une deuxieme vague d immigrants a Tombouctou est provoquee par l attraction qu'exerçait la ville sur le monde soudano-sahelien tant par sa prosperite economique que par la reputation des Docteurs que ses murs renfermaient. Ainsi du Tichitt, de Takkeza, du Touat, de Djenne, du Macina, vinrent un nombre important de Docteurs celebres parmi lesquels Mohamed Bagayoko, type ideal du docteur Tombouctien, qui se voua tout entier au service de Dieu, de sa communaute et de la societe.